O MapBiomas Mata Atlântica Trinacional envolve pesquisadores e especialistas em sensoriamento remoto, SIG, computação, biomas e usos do solo de cada um dos países participantes (Argentina, Brasil e Paraguai). A equipe argentina é coordenada pela Fundación Vida Silvestre Argentina, a equipe brasileira pelo ArcPlan e a equipe paraguaia por meio do WWF Paraguai. As equipes trabalham de forma coordenada processando as informações na nuvem por meio da plataforma Google Earth Engine.